（1）嚴格遵循循環(huán)再生．和諧共存、整體優(yōu)化、區(qū)域分異等生態(tài)學原理

循環(huán)再生原理：生態(tài)系統(tǒng)通過生物成分，一方面利用非生物成分不斷地合成新的物質(zhì)，一方面又把合成物質(zhì)降解為原來的簡單物質(zhì)，并歸還到非生物組分中。如此循環(huán)往復，進行著不停頓的新陳代謝作用。這樣，生態(tài)系統(tǒng)中的物質(zhì)和能量就進行著循環(huán)和再生的過程。生態(tài)修復利用環(huán)境一植物一微生物復合系統(tǒng)的物理、化學、生物學和生物化學特征對污染物中的水、肥資源加以利用，對可降解污染物進行凈化，其主要目標就是使生態(tài)系統(tǒng)中的非循環(huán)組分成為可循環(huán)的過程，使物質(zhì)的循環(huán) 和再生的速度能夠得以加大，最終使污染環(huán)境得以修復。

和諧共存原理：在生態(tài)修復系統(tǒng)中，由于循環(huán)和再生的需要，各種修復植物與微生物種群之間、各種修復植物與動物種群之間、各種修復植物之間、各種微生物之間和生物與處理系 統(tǒng)環(huán)境之間相互作用，和諧共存，修復植物給根系微生物提供生態(tài)位和適宜的營養(yǎng)條件，促進一些具有降解功能微生物的生長和繁殖，促使污染物中植物不能直接利用的那部分污染物轉(zhuǎn)化或降解為植物可利用的成分，反過來又促進植物的生長和發(fā)育。

整體優(yōu)化原理：生態(tài)修復技術(shù)涉及點源控制、污染物阻隔、預處理工程、修復生物選擇和修復后土壤及水的再利用等基本過程，它們環(huán)環(huán)相扣，相互不可缺少。因此，必須把生態(tài)修復系統(tǒng)看成是一個整體，對這些基本過程進行優(yōu)化，從而達到充分發(fā)揮修復系統(tǒng)對污染物的凈化功能和對水、肥資源的有效利用。

區(qū)域分異原理：不同的地理區(qū)域，甚至同一地理區(qū)域的不同地段，由于氣溫、地質(zhì)條件、土壤類型、水文過程以及植物、動物和微生物種群差異很大，導致污染物質(zhì)在遷移、轉(zhuǎn)化和降 解等生態(tài)行為上具有明顯的區(qū)域分異。在生態(tài)修復系統(tǒng)設計時，必須有區(qū)別地進行工藝與修復生物選擇及結(jié)構(gòu)配置和運行管理。

（2）影響因素多而復雜
生態(tài)修復主要是通過微生物和植物等的生命活動來完成的，影響生物生活的各種因素也將成為影響生態(tài)修復的重要因素，因此，生態(tài)修復也具有影響因素多而復雜的特點。

（3）多學科交叉
生態(tài)修復的順利施行，需要生態(tài)學、物理學、化學、植物學、微生物學、分子生物學、栽培學和環(huán)境工程等多學科的參與，因此，多學科交叉也是生態(tài)修復的特點。